Ein großer Teil der ursprünglich spätgotischen Form der Kirche St. Anna hat bis heute überlebt. Ab dem ersten Viertel des 16. Jahrhunderts gibt es ein breites, geräumiges Schiff, das ursprünglich kein Steingewölbe hatte, obwohl dies wahrscheinlich aufgrund der äußeren Strebepfeiler geplant war, die das gesamte Gebäude umgeben. Der Chor war von Anfang an gewölbt. Sein Maschengewölbe weist eine Ähnlichkeit mit dem Chorgewölbe der Benediktiner-Klosterkirche St. Ulrich und St. Afra in Augsburg, deren Restaurierung Burkhard Engelberg im letzten Viertel des 15. Jahrhunderts leitete. Der Turm der St.-Anna-Kirche wurde zunächst etwa bis zur Hälfte seiner Höhe errichtet, dann wurde der Chor überdacht und der Turmbau fortgesetzt. Das Zwiebelhaube des Turms, die neue Sakristei vor dem Chor, die umlaufende Kapelle und die Westfassade der Kirche mit dem Grabmal sind das Ergebnis späterer barocker Anbauten.
